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11 月 18 日，中国工程院办公厅工作人员表示，中国工程院会针对网络反映曹雪涛院士的有关问题展开调查。 “我们已经了解到网络上有关曹雪涛院士的投诉，我们会调查处理这件事情，但是进一步调查处理也需要花时间，具体以什么形式展开调查，目前暂时还不掌握最新情况，只是说我们肯定会调查。”上述人士表示。
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曹雪涛于 11 日 15 日下午、事件刚开始发酵不久后回应《中国新闻周刊》询问时表示，“我现在刚到上海实验室，要把这些事情查一下。我知道大家关注这个事情，查完了，我会给大家一个回复。”
此后曹雪涛本人在 PubPeer 上正式回复了 Bik，他称赞了后者为维护学术正当所做的努力，并表示他也高度重视 Bik 提出的问题，并已将 Bik 质疑的问题论文列为了“最高优先级”，会与团队和合作者仔细复盘论文稿件、原始数据与实验室记录，如发现严重危及论文准确性的问题，会立即与相关期刊的编辑联系并处置。
曹雪涛同时在信中说，他仍对受质疑论文的科学有效性、可重复性充满信心。但如若作为研究团队领导和管理者出现疏忽，他也责无旁贷。对于此次事件引起的不便，曹雪涛在信中还对他目前及从前的学生、实验室工作人员、同事、同行，以及科学社群致歉。
曹雪涛回应：
部分一作回应：
是无心失误还是有心造假呢？
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